Пакет: flye (2.9.1+dfsg-1)

Връзки за flye

Ресурси за Debian:

Изтегляне на пакет-източник flye.

Отговорници:

Външни препратки:

Начална страница [github.com]

Подобни пакети:

de novo assembler for single molecule sequencing reads using repeat graphs

Flye is a de novo assembler for single molecule sequencing reads, such as those produced by PacBio and Oxford Nanopore Technologies. It is designed for a wide range of datasets, from small bacterial projects to large mammalian-scale assemblies. The package represents a complete pipeline: it takes raw PacBio / ONT reads as input and outputs polished contigs. Flye also has a special mode for metagenome assembly.

Други пакети, свързани с flye

зависимости

препоръчани

предложени

enhances

dep: libc6 (>= 2.34)

GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

GCC support library
dep: libstdc++6 (>= 11)

GNU Standard C++ Library v3
dep: minimap2

versatile pairwise aligner for genomic and spliced nucleotide sequences
dep: python3

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
dep: samtools

processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

compression library - runtime

Изтегляне на flye

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
mips64el	22 556,1 кБ	37 072,0 кБ	[списък на файловете]